Der größenwahnsinnige Wissenschaftler Zorndyke brachte die Polkappen zum Schmelzen, ließ Millionen von Menschen hilflos ertrinken und hetzt nun seine gezüchteten Gen-Kreaturen auf die Überlebenden. Dabei hat der die Rechnung ohne Mayumi und Tetsu gemacht: Die beiden gehören der Organisation Blue an und stellen sich dem Bösewicht! Als erster, ausschließlich am Computer entstandener Anime begeistert Blue Submarine No. 6 mit genialen Computeranimationen und atemberaubenden Special-Effects...