ANNO DS ist ein echtes ANNO: Entdecken, besiedeln und handeln sind die zentralen Elemente des Spiels. Dabei wurden die besonderen Möglichkeiten der Hardware ausgenutzt. ANNO DS lässt sich komplett mit dem Stylus steuern. Auf dem oberen Screen steht ein liebevoll animierter Berater dem Spieler helfend zur Seite, während der untere Bildschirm die Spielwelt zeigt. ANNO DS bietet über die drahtlose DS-Datenübertragung einen Multiplayer-Modus für 4 Spieler an.