Nachdem Forensikerin Dr. Bones Brennan von ihrer Forschungsreise zurück ist und sich FBI-Agent Booth von seiner Operation weitgehend erholt hat, wartet auf das Dreamteam schon wieder jede Menge Arbeit.
In den schaurig-skurrilen Fällen geht es unter anderem um eine ominöse Hellseherin, eine Mumie im Zaun, einen Zwerg, der Profiwrestler war, einen vermeintlich gutherzigen Hausbesitzer und einen Toten, der seltsamerweise auch Merkmale eines Vogels besitzt. Was Bones und … mehrBooth aber mindestens genauso beschäftigt, wie die Leichen auf dem Seziertisch, sind ihre nach wie vor undefinierten Gefühle zueinander. Kann es für die beiden eine gemeinsame Zukunft geben? Klar ist, dass jeder von ihnen eine wichtige Entscheidung treffen muss möglicherweise die wichtigste ihres Lebens.

Episoden:
Disc 1:
01 Ein Medium für die Liebe und den Tod
02 Ein Agent im Kofferraum
03 Das Einfache im Wunderkind
04 Es geschah an einem schönen Tag in der Vorstadt

Disc 2:
05 Nacht im Bones-Museum
06 Hennen, Hahn und Hinterlist
07 Ein Zwerg, reich unt tot, war einmal in Not
08 Leben zu Asche in Einfamilienhaus

Disc 3:
09 Heute: Leiche in Öl
10 Was vom Mann der Weihnacht übrig blieb
11 Das X in der Akte
12 Im Pudding liegt die Wahrheit

Disc 4:
13 Die Geheimnisse und ein Zahnarzt
14 Der Teufel steckt im Detail
15 Die Liebe und die Dunkelheit
16 Weniger als die Summe aller Teile?

Disc 5:
17 Die Klasse von 1994
18 Das Bein im Biest aus dem Becken
19 Ein Rocker im Spülgang
20 Zwei Hexen im abgebrannten Haus

Disc 6:
21 Ungesunder Menschenverstand
22 Zum Schluss fängt alles an weniger