Ninja BladeT ist ein Action-Adventure, das euch in das moderne Tokio entführt. Als Alpha-Würmer bekannte Parasiten, die urplötzlich aufgetaucht sind, bedrohen die gesamte Menschheit und breiten sich immer schneller in Richtung der Metropole Tokio aus. Um die Bedrohung abzuwehren, schickt die Regierung ein Team erfahrener Elite-Kämpfer in die Schlacht. Sie müssen alles geben, um die Menschheit vor der Vernichtung zu bewahren.